Насколько я понимаю (я не сотрудник паспортного стола), там вся разница в считывании анкеты - в первом случае анкета заполняется автоматически, во втором считывается сканером, и далее редактируется сотрудником МВД. За счет этого, обслуживание быстрее (несколько минут заместо 10-20 мин. на каждого поситителя), и очередь меньше. В обоих случаях требуется фотографирование on-site для занесения на электронныи носитель, и проверка в компетентных органах, занимающая несколько недель, поэтому общее время обработки заявки сопоставимо (2-4 недели).