Они приняты и распространены именно по этой самой причине. Регистрация домена второго уровня там всегда требовала наличия торговой марки, поэтому com.ua и прочие третьеуровневые, к которым не предъявлялось подобных требований, значительно более популярны.
Крупные компании, которых не останавливают сложности, обычно регистрируют стандартные второуровневые - yandex.ua, kyivstar.ua, rbc.ua

Гугл в com.ua потому, что все идиотские антикиберсквоттерские ограничения никогда не работают, и google.ua был захвачен человеком, зарегистрировавшим ООО с названием что-то типа "Го Огле", оформившим торговую марку и зарегистрировавшим домен на себя. Его отсудили обратно сравнительно недавно.