herd immunity may be implicated

[borislvin]

Fatality rates related to COVID-19 in Japan have been low compared to Western Countries and have decreased despite the absence of lockdown. Serological tests monitored across the course of the second wave can provide insights into the population-level prevalence and dynamic patterns of COVID-19 infection.

<...>

Six hundred fifteen healthy volunteers <...> received at least one test. Seroprevalence increased from 5.8 % to 46.8 % over the course of the summer. The most dramatic increase in SPR occurred in late June and early July, paralleling the rise in daily confirmed cases within Tokyo, which peaked on August 4. Out of the 350 individuals <...>who completed both offered tests, 21.4 % of those individuals who tested seronegative became seropositive and seroreversion was found in 12.2 % of initially seropositive participants. 81.1% of IgM positive cases at first testing became IgM negative in approximately one month.

Conclusions and Relevance: COVID-19 infection may have spread widely across the general population of Tokyo despite the very low fatality rate. Given the temporal correlation between the rise in seropositivity and the decrease in reported COVID-19 cases that occurred without a shut-down, herd immunity may be implicated.

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.09.21.20198796v1
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.09.21.20198796v1.full.pdf

Comments

[psysa-pin.livejournal.com]

One in 10 may have caught COVID, as world heads into 'difficult period': Mike Ryan, Executive Director of the WHO

Our current best estimates tell us about 10% of the global population may have been infected by this virus. It varies depending on country, it varies from urban to rural, it varies depending on groups. But what it does mean is that the vast majority of the world remains at risk," Ryan said.
"We are now heading into a difficult period. The disease continues to spread," he said.

https://www.yahoo.com/news/one-10-may-caught-covid-121301649.html

10% населения Земли – это примерно 800 млн.человек, что на порядок больше официальной цифры в 35 млн.заболевших.
Теперь и WHO поддержала гипотезу, опубликованную в Economist, что скрытое заражение гораздо больше и началось раньше (соответственно, летальность гораздо ниже):

Economist: Исследования антител по всему миру показывают, что количество переболевших ковидом раз в 10 больше, чем официально зарегистрировано.

https://www.economist.com/briefing/2020/09/26/the-covid-19-pandemic-is-worse-than-official-figures-show

[bibliofil.livejournal.com]

С другой стороны:

Borough Park in NYC has one of the highest antibody rates seen in the developed world: 43.9%, based on a huge testing program covering almost 1/3 of local pop. This week positivity rates of Covid-19 tests coming back hit 17%.

[bbb.livejournal.com]

Мне вообще непонятно, что тут с какой стороны. Я вижу, что эту фразу процитировал Тайлер Коуэн (https://marginalrevolution.com/marginalrevolution/2020/09/herd-immunity-update.html), но источник, то есть статья WSJ, под замком. Поэтому я не знаю, что на самом деле написано в статье, откуда цифры и что за ними стоит. Например, рост процента позитивности тестов может означать, что люди стали реже брать тесты из чисто проверочных соображений, просто на всякий случай или для того, чтобы предъявить работодателю, пограничнику или в гостинице.

[alacsony.livejournal.com]

Тут ещё отдельная хитрость в том, что это ортодоксальный район. Поэтому рост на 17% может быть, например, от того, что кто-то сбежал от праздничного локдауна в Израиле (причем сбежал большой семьей). 43% с антителами тоже могут быть не из самой репрезентативной выборки (кому-то религия позволила, кому-то нет)

[ak-47.livejournal.com]

У меня статья открывается если зайти на сайт со страницы поисковика:

---

Coronavirus Cases Rise in Parts of New York City
Areas with highest infection rates generally are home to large communities of ultra-Orthodox Jewish families

By Melanie Grayce West
Updated Sept. 28, 2020 4:46 pm ET

Covid-19 cases continue to surge in several neighborhoods in New York City and in neighboring Rockland and Orange counties, a worrisome sign that a handful of hotspots may develop into wider community spread.

New York Gov. Andrew Cuomo said Monday that the rate of infection in 10 of the state’s ZIP Codes was about 15%, but those areas represent about 25% of new cases in the state.

The top 10 ZIP Codes include two in Rockland County, encompassing the areas around Monsey and Spring Valley. In ZIP Code 10977, 30% of people tested were positive, while it was 25% in ZIP Code 10952.

In Orange County, ZIP Code 10950, the positivity rate was 22%; that neighborhood includes the cities of Kiryas Joel and Monroe.

In addition, eight neighborhoods in Brooklyn and Queens are outpacing the New York City-wide average by 3.7 times over the past two weeks, city health officials have said. In the Borough Park neighborhood, ZIP Code 11219, the Covid-19 positivity rate was 17%, said Mr. Cuomo. In the Midwood ZIP Code, he said, the positivity rate was 11%.

“I want a quick response,” said Mr. Cuomo.

The areas where the infection rates are highest are generally home to large communities of ultra-Orthodox Jewish families.

New York City health officials said Monday that Covid-19 positivity rates in four other Brooklyn neighborhoods, which sit adjacent to the hot-spot areas, are also rising. Those new neighborhoods included the Brighton Beach area, Kensington and Windsor Terrace in Brooklyn, and Kew Gardens and Rego Park in Queens. Kew Gardens, according to the health department, now has a positivity rate greater than 3%, using a 14-day average.

Elsewhere in New York City, the infection rate has held at about 1% in recent months.

On Monday, New York City Mayor Bill de Blasio said the city’s rate of people who tested positive for Covid-19 was at 1.93%. Health-department data also show an increase in the city overall in the number of hospitalized patients with Covid-19. This week, the city is set to further open schools and will roll out limited indoor dining.

City health officials said last week that they would consider measures including shutting down nonessential businesses and limiting the size of gatherings if the infection rates didn’t improve in the hot-spot areas.

Health commissioner Dave Chokshi has said the health department will move as swiftly as the situation warrants. The health department said Monday that it would be deploying 11 mobile-testing units in hot spots, and will conduct outreach to nonpublic schools.

Elsewhere in New York City, the infection rate has held at about 1% for weeks.

Mr. Cuomo, a Democrat, urged local governments to enforce social distancing and mask-wearing regulations. He said the state had supplemented enforcement in some areas, including at bars and restaurants. He said the state would make machines for rapid-testing of Covid-19 available immediately to local governments and to private schools in the most-affected areas.

“You’re going to make more people unhappy if the infection rate comes up and we have to close business or tighten up gatherings,” the governor said. “If you don’t act responsibly, it’s going to be worse.”

—Jimmy Vielkind contributed to this article.

Write to Melanie Grayce West at melanie.west@wsj.com

[bbb.livejournal.com]

Спасибо!

[bibliofil.livejournal.com]

Я прочитал вот здесь:

https://twitter.com/Birdyword/status/1311208954836316160?s=19

[dmpogo.livejournal.com]

С другой стороны, я пока еще лично не знаю ни одного с положительным тестом

[bbb.livejournal.com]

Я знаю, но дело-то не в этом. Суть в том, что более или менее адекватную картину невозможно получить без панельных тестов - охватывающих популяцию целиком или хотя бы рандомизированно. Тестирование, которое происходит сейчас, практически целиком имеет эндогенный характер.

[dmpogo.livejournal.com]

Ну так bias имеющихся тестов должен быть в сторону преувеличения распространенности вируса, нет ?
У нас вот на выходных 45000 тестов - 600 положительных, 1.3%. И это когда снова рекомендовано без симптомов не хотить (хотя некоторые категории тестируются без желания). С какой стати ожидать что в случайной выборке было бы больше носителей ?

[bbb.livejournal.com]

Так это же разные тесты. Та статистика, которую обычно публикуют - это тесты на вирус (PCR), то есть они выявляют тех, кто является инфицированным прямо вот на момент тестирования. А панельные тесты, которые позволяют, хоть и с большой долей условности, оценить масштабы инфицирования за прошедшее время - это серологические тесты на антитела. То есть что вируса уже нет, но неприятный осадок остался.

[dmpogo.livejournal.com]

Мне показалось что у вас вопрос по другому поставлен.

Я понимаю что серологические на антитела. Не уверен что они нам говорят. Ну то есть говорят что вирус мимо проходил, и что ? Сколько вируса, и главное, свидетельствует ли это об иммунитете ? Где порог ?

[bbb.livejournal.com]

Так в том и дело, что никто пока не знает, где этот порог и точно ли он есть вообще. И именно для того, чтобы лучше понять, где он может находиться, и нужны панельные серологические тесты. Они, конечно, не дадут однозначный ответ сами по себе, но без них разговор превращается по большей части в гадание на кофейной гуще.

[dmpogo.livejournal.com]

Конечно нужны !

[bibliofil.livejournal.com]

У меня 19 летняя дочка переболела. Без симптомов кроме потери обоняния и вкуса на месяц.

А у коллеги - 8 летняя дочка в больнице

[dmpogo.livejournal.com]

Дай бог чтобы у вашей дочери на этом все закончилось а у коллеги дочь поправилась.

Если что, я не про то что люди не болеют, а про оценку распространенности. У нас в университете на
50 тысяч сотрудников и студентов известно про четыре случая (среди студентов). В городе - 1000 active cases на миллион (а всего с известными выздоровшими - тысяч 10) . Мне кажется что оценка что вирус прошел уже по больше чем 10 процентам мирового населения слишком оптимистична. Хотя конечно, кто знает, чем больше тем лучше конечно.

Единственный мне известный случай когда я знаю человека в лицо - коллега из Парижа. У которого кстати кончилось плохо - паралич половины лица.

[bibliofil.livejournal.com]

Слишком много различий в разных странах по многим параметрам чтобы делать какие либо выводы. В каких-то странах работает одно. В других - тоже самое не работает.

В Азии похоже вообще встроенный иммунитет.

А у нас в Испании волна за волной несмотря на 100% маски

[bibliofil.livejournal.com]

И кстати. Дочка переболела - а мы, 4, нет. Хотя не соблюдали никакие предосторожности. И даже наоборот - хотелось переболеть и все.

[dmpogo.livejournal.com]

Таких случаев много. Действительно у этого вируса заражаемость какая то очень неоднородная.
То люди живут вместе и ничего, то собрались в гости на пару часов и от одного все заразились

[igo-su.livejournal.com]

Не было ли раньше такой неоднородности и у других ОРВИ?

[alacsony.livejournal.com]

Экстраполяция результатов добровольного тестирования сразу заставляет вспомнить оглушительную победу Альфа Лэндона над Франклином Рузвельтом по версии журнала Literary Digest.

[bbb.livejournal.com]

Почему же? Там написано, что участвовать в тесте было предложено добровольцам из популяции работников некоей компании, имеющей офисы в разных районах Токио (Healthy volunteers from 1877 employees of a large Japanese company were recruited to the study from 11 disparate locations across Tokyo). В итоге протестировано было 615 человек, то есть добровольцем стал каждый третий. По-моему, это очень немаленький охват.

Собственно, возвращаясь к той знаменитой истории с Лэндоном - мы же не победу предсказываем, а просто оцениваем масштабы, причем самым приблизительным образом. Лэндон проиграл, но что за него проголосовало очень много избирателей, что он вовсе не был маргиналом - было подтверждено.

[alacsony.livejournal.com]

>Лэндон проиграл, но что за него проголосовало очень много избирателей, что он вовсе не был маргиналом - было подтверждено.

Это безусловно так, но параллельно Гэллап таки предсказал победителя. В рассматриваемом случае своего Гэллапа явно нет, поскольку по охвату тестированием Япония находится на почетном 151 месте между Мавританией и Гондурасом. Поэтому оценка масштабов даже на уровне добровольцев весьма полезна. Но для вывода о коллективном иммунитете нужна более качественная выборка.